L'Institut Pasteur de Côte d'Ivoire (IPCI), dans sa mission de surveillance et d'appui à la santé publique est une pièce essentielle de la gouvernance hospitalière. Depuis 2011, l’IPCI dispose d’une Biobanque qui est un dispositif de souveraineté national et sous régional. Cette biobanque permet de conserver les échantillons des maladies prioritaires afin d’assurer la riposte face aux différentes pandémies et épidémies. Une étude pilote conçue et réalisée pendant la pandémie à Covid 19 a permis de conserver plus de 100 000 échantillons provenant d'Abidjan, la capitale économique et de l'intérieur du pays. Le biobanking a été réalisé selon un processus de production des paillettes (0,3ml) qui sont des aliquotes d’échantillons primaires scellés avec une étanchéité. Ce processus s’est effectué selon deux techniques, manuelle et semi-automatique en utilisant le Système de Scellage Manuel (SYMS) et l'instrument semi-automatique (PACE). En renforçant les mesures de biosécurité concernant la manipulation des échantillons, la technique semi-automatique (PACE) a permis un gain de temps dans la productivité des paillettes. Les paillettes cryoconservés ont été mis à disposition des équipes de chercheurs permettant de détecter les variants du SARCoV2 (alpha, delta, omicron) circulant en Côte d’Ivoire. Cette expérience se poursuit avec l’actuelle épidémie de MonkeyPox.